深圳市第三儿童医院由深圳市妇幼保健院运营管理，是一家市属公立综合性儿童医院。医院位于龙岗区龙岗街道协联路1号，占地面积3.5万平方米，总建筑面积11.6万平方米，规划床位500张。作为深圳东部片区首个大型儿童专科医院，深圳市第三儿童医院的落成有效填补了区域儿科医疗资源空白，惠及龙岗、坪山等周边及更广泛区域的居民。

运营管理方深圳市妇幼保健院是南方医科大学妇女儿童医学中心、三级甲等妇幼保健院，拥有以产科、新生儿科双国家临床重点专科为引领，以儿科与儿童保健、妇科和生殖为核心的优势学科群，多次获全国妇幼保健机构绩效监测A++评级。为保障新医院高起点、高质量运行，市妇幼保健院将其国家级、省级重点专科等优势资源全面延伸至市第三儿童医院，首批定向派驻专业人员118名（含高级职称专家54名），确保两院管理一体、技术平移、服务同质。

“十五五”期间，医院将充分发挥深圳市妇幼保健院运营管理优势，加快建成立足东部、服务全市、辐射粤港澳大湾区的集医疗、科研、教学、预防、保健为一体的高水平儿童医院，全力守护每一位孩子的健康成长。